دکتر مرتضی عبداللهی دارای مدرک دانشنامه تخصصی پزشکی اجتماعی و پزشکی عمومی از دانشگاه علوم پزشکی تهران است.

وی در سال ۱۳۷۸ عضو هیئت علمی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی شد و تاکنون با مرتبه علمی دانشیار در حال ارایه خدمت بوده  است.

همکاری در طراحی و اجرای طرح‌های ملی انستیتو تحقیقات تغذیه از سال ۱۳۷۸ با مشارکت وزارت بهداشت، سازمان بهداشت جهانی و یونیسف، جهاد کشاورزی، پژوهشکده غلات و وزارت کار و رفاه، راه اندازی طرح ملی کوهورت معلمان با همکاری دانشگاه هاروارد از جمله سوابق علمی وی است.

از مهمترین سوابق اجرایی دکتر عبداللهی می توان به معاون پژوهش و فناوری انستیتو برای دو دوره، رییس مرکز تحقیقات عوامل اجتماعی، شورای تحریریه مجلات دانشگاه و عضو کمیته سلامت و امنیت غذایی استان تهران اشاره کرد.